酵素在动物和植物中均有，它们参与生物体所有的活动，目前已知的酵素有数千种，是维持生物体功能正常、消化食物、修復组织等必需的。即使摄取了足够热量、维他命、矿物质、水分及蛋白质，没有酵素也无法维持生命，许多罕见疾病都是因為患者缺乏某些酵素而引起致命反应。

生物体内的酵素依功能可分為水解酵素、氧化还原酵素、接合酵素、异构酵素、裂解酵素、转移酵素6大类。以下例举比较重要的消化系统及骨骼肌肉酵素功能来做说明：

<消化系统酵素水解功能>

刘纯君表示，生物体内是一个大型的酵素反应中心，以消化系统中酵素的水解功能来说，从嘴的「淀粉分解酵素感应区」，到胃裡的胃酸和胃蛋白分解酵素则可把食物变成糜状，食物经幽门到小肠时，有来自肝臟可乳化脂肪、协助脂肪酵素功能的胆盐，还有来自胰臟的淀粉分解酵素、胰蛋白酵素、脂肪分解酵素，把醣类、蛋白质、脂肪等分解到其组成的最小单位，由小肠把食物的营养吸收到体内，由血液循环送至各个器官使用。

<骨骼及肌肉组织相关酵素>

嘉义长庚復健科主任许宏志表示，在骨骼及肌肉等软组织中，酵素也担负著很重要的工作。

其中之一是和肌肉代谢有关的肉硷(carnitine )，在人体有左旋(L型)和右旋(D型)两种肉硷，左旋和人体生化反应较為相容且可自行合成，因此称為生理性肉硷，普遍存在人体肌肉、神经组织和脑细胞内，和肌肉的代谢很有关係。

肉硷主要功能是帮助粒线体燃烧脂质，细胞粒线体像人体的马达，它的能源是葡萄糖和脂肪，人体运作时首先动用葡萄糖的热量，但长期能量则要燃烧脂肪，然而脂肪容易燃烧不完全，氧化不完全就会產生代谢废物;如乳酸堆积导致肌肉痠痛及酸毒性，或导致自由基堆积，易造成老化、细胞突变等。肉硷可说是助燃剂，提供运输脂肪到粒线体，帮助脂肪燃烧，提供抗氧化的功能。肉硷目前被视為保健补充品的明日之星，运动员补充可助体力恢復;由於肉硷的主要成分是赖氨酸和甲硫氨酸、维他命B3、B6和维他命C，前三者需从蛋白质摄取，因此素食者也很需要;而节食时肉硷也有助脂肪燃烧;更重要的是，肉硷可保护脑神经，延缓失智症患者脑细胞退化。

和骨骼有关的酵素则是「选择性雌激素受器调控剂(SERM)」，它可调控细胞的雌激素受器，具有雌激素促进骨质生长的优点，却无雌激素过量容易致癌的缺点，可促进身体的骨生长平衡，刺激骨生长而避免骨质疏鬆症。

和软骨有关的酵素则是「组织抑制金属蛋白酶(TIMP)」，许宏志说，人体内有种专门破坏软骨组织的酵素──金属蛋白酶(MMP)，TIMP可以抑制MMP对软骨的破坏，如果MMP/TIMP平衡出现问题，易造成软骨提早退化。